【前沿】復(fù)旦大學(xué)在人感染H7N9地理分布模式、傳播風(fēng)險(xiǎn)及活禽市場(chǎng)關(guān)閉效果評(píng)估方面取得新進(jìn)展
導(dǎo)語(yǔ)
? ? ? ?自2013年3月中國(guó)發(fā)現(xiàn)全球首例人感染禽流感H7N9病例以來(lái),每年冬春季都會(huì)出現(xiàn)人感染禽流感H7N9疫情。人感染禽流感H7N9地理分布模式、傳播風(fēng)險(xiǎn)及活禽市場(chǎng)關(guān)閉效果評(píng)價(jià),將為禽流感H7N9防控措施的制定提供科學(xué)證據(jù)。2018年1月,Emerging Infectious Diseases 雜志和Scientific Reports 雜志依次發(fā)表了復(fù)旦大學(xué)余宏杰研究團(tuán)隊(duì)與布魯塞爾自由大學(xué)及香港大學(xué)等合作的題為 Changinggeographic patterns and risk factors for avian influenza A(H7N9) infection inhumans, China 和Evaluation of animal-to-human andhuman-to-human transmission of influenza A(H7N9) virus in China, 2013-15 的研究論文。研究結(jié)果顯示:①第五波H7N9疫情的空間分布與雞鴨比、活禽市場(chǎng)密度、家禽密度與至湖泊距離等因素密切相關(guān);②關(guān)閉活禽市場(chǎng)仍是控制H7N9的關(guān)鍵。為禽流感H7N9防控措施的制定提供了有力的科學(xué)證據(jù)。
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研究背景
?????? 自2013年3月中國(guó)發(fā)現(xiàn)全球首例人感染禽流感H7N9病例以來(lái),每年冬春季都會(huì)出現(xiàn)人感染禽流感H7N9疫情。根據(jù)世界衛(wèi)生組織2017年9月26日最新數(shù)據(jù),來(lái)自中國(guó)大陸27個(gè)省市的人感染H7N9禽流感確診病例高達(dá)1533例,病死率接近40%。持續(xù)的病毒學(xué)和流行病學(xué)監(jiān)測(cè)和研究是大流行風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估的重要內(nèi)容,人感染禽流感H7N9地理分布模式、傳播風(fēng)險(xiǎn)及活禽市場(chǎng)關(guān)閉效果評(píng)價(jià),將為禽流感H7N9防控措施的制定提供科學(xué)證據(jù)。
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研究結(jié)果
1.第五波H7N9疫情的空間分布與雞鴨比、活禽市場(chǎng)密度、家禽密度與至湖泊距離等因素密切相關(guān)。
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? ? ? ? 人感染禽流感H7N9疫情地理空間分布相關(guān)的生態(tài)學(xué)因素是什么?未來(lái)出現(xiàn)疫情的高風(fēng)險(xiǎn)區(qū)域在哪里?這些問(wèn)題的解答將為禽流感H7N9防控措施的制定提供科學(xué)證據(jù)。復(fù)旦大學(xué)余宏杰研究團(tuán)隊(duì)發(fā)表于Emerging Infectious Diseases雜志上的《Changing geographic patterns and risk factors for avian influenzaA(H7N9) infection in humans, China》研究論文給了大家很好的提示。
? ? ? ?研究者基于H7N9疫情的地理分布及預(yù)測(cè)變量(活禽市場(chǎng)密度、家禽密度、人口密度及濕地覆蓋比等),應(yīng)用泊松增強(qiáng)回歸樹(shù)模型及廣義線性混合模型,評(píng)估與H7N9疫情分布相關(guān)的生態(tài)學(xué)因素(表1)。研究結(jié)果表明,第五波H7N9疫情的空間分布與雞鴨比、活禽市場(chǎng)密度、家禽密度與至湖泊距離等因素密切相關(guān),其相對(duì)貢獻(xiàn)分別為20.49%、18.41%、15.88%與7.31%(圖1)。從前三波到第四、五波疫情,H7N9空間分布的預(yù)測(cè)變量由活禽市場(chǎng)密度轉(zhuǎn)變?yōu)榍蓊惷芏龋▓D2)。季節(jié)性分布結(jié)合熱圖分析結(jié)果顯示,大多數(shù)H7N9人感染病例發(fā)生在2-3月左右,具有緯度梯度,H7N9和季節(jié)性流感的峰值在空間和時(shí)間上無(wú)強(qiáng)烈重合(圖 3)。本研究提示,H7N9可依賴于家禽運(yùn)輸或交易擴(kuò)散,從而導(dǎo)致人感染H7N9地理范圍擴(kuò)大。
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圖1. 中國(guó)禽流感H7N9疫情發(fā)病率估計(jì)及其預(yù)測(cè)變量的邊緣效應(yīng)圖
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圖2.中國(guó)、廣東省與長(zhǎng)江三角洲禽流感H7N9發(fā)病預(yù)測(cè)變量分布(A.家禽密度、活禽市場(chǎng)密度、雞鴨比分布;B.H7N9發(fā)病數(shù)分布;C.前四波與第五波H7N9疫情地理分布比較。)
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圖3 H7N9流感感染的季節(jié)性分析,2013-2017(A. Epidemiccurve for H7N9.B. Seasonalityfor H7N9.C. Seasonalityfor seasonal influenza)
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2. 活禽市場(chǎng)關(guān)閉仍是防控H7N9的關(guān)鍵。
? ? ? ?活禽市場(chǎng)關(guān)閉是防控禽流感H7N9的重要措施。盡管我國(guó)多數(shù)省市的活禽市場(chǎng)已采取了不同形式的關(guān)閉措施,但其對(duì)禽流感H7N9病毒的傳播及流行的防控效果仍需進(jìn)一步研究。復(fù)旦大學(xué)余宏杰研究團(tuán)隊(duì)另一篇發(fā)表于Scientific Reports(IF=4.3)上的《Evaluation ofanimal-to-human and human-to-human transmission of influenza A(H7N9) virus inChina, 2013-15》的研究也進(jìn)行了精彩評(píng)估。
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?????? 研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)系統(tǒng)收集和分析活禽市場(chǎng)關(guān)閉與人感染禽流感H7N9病例資料,構(gòu)建禽到人傳播及人際傳播的模型,定量評(píng)估了人感染禽流感H7N9病毒從禽到人,以及人與人之間的傳播風(fēng)險(xiǎn),并同時(shí)評(píng)估了活禽市場(chǎng)的關(guān)閉效果。
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? ? ? ?研究者對(duì)來(lái)自9個(gè)城市的活禽市場(chǎng)關(guān)閉與病例的關(guān)系進(jìn)行分析,結(jié)果表明,活禽市場(chǎng)關(guān)閉與各地區(qū)H7N9發(fā)病率顯著下降密切相關(guān)。深圳、蘇州、廈門、上海等地采取活禽市場(chǎng)關(guān)閉措施前后,估計(jì)發(fā)病率約降低了95-96%(圖4)。前三波H7N9疫情的有效人際傳播指數(shù)分別為0.2(95% CI: 0.05-0.47)、0.16(95% CI: 0.01-0.41)與0.16(95% CI: 0.01-0.45)。人感染禽流感H7N9病毒的平均發(fā)病潛伏期為2.6天(95%CI: 1.4-3.1)。此外,研究發(fā)現(xiàn),禽流感H7N9病例的報(bào)告發(fā)病率、首發(fā)病例與二代病例的發(fā)病間隔對(duì)人際有效傳播指數(shù)存在一定的影響。本研究提示,活禽市場(chǎng)關(guān)閉是控制H7N9疫情的有效干預(yù)措施,采取活禽市場(chǎng)關(guān)閉措施,可顯著降低H7N9從禽到人的傳播。
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圖4.禽流感H7N9發(fā)病分布及其日發(fā)病數(shù)后驗(yàn)估計(jì)
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小 結(jié)
????? 上述兩項(xiàng)研究均得到國(guó)家自然基金委杰出青年基金(81525023)的資助,通過(guò)對(duì)人感染禽流感H7N9地理分布模式、傳播風(fēng)險(xiǎn)及活禽市場(chǎng)關(guān)閉效果評(píng)價(jià),得出兩個(gè)重要結(jié)論:①第五波H7N9疫情的空間分布與雞鴨比、活禽市場(chǎng)密度、家禽密度與至湖泊距離等因素密切相關(guān);②關(guān)閉活禽市場(chǎng)仍是控制H7N9的關(guān)鍵。為禽流感H7N9防控措施的制定提供了科學(xué)證據(jù)。
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? ? ? ?結(jié)合國(guó)內(nèi)最新疫情,2017年12月2日,云南省衛(wèi)生計(jì)生委通報(bào):11月30日,云南確診1例H7N9病例,據(jù)悉,這是今年10月以來(lái)國(guó)內(nèi)發(fā)生首例人感染H7N9病例。按照往年H7N9的流行特點(diǎn),每年的1-3月份會(huì)進(jìn)入高發(fā)期,鐘南山院士前不久也強(qiáng)調(diào),一定要警惕今年1-3月份以H7N9為主的禽流感疫情的發(fā)生及傳播。至2017年6月以來(lái),我國(guó)已全面展開(kāi)家禽H7N9疫苗免疫,今冬明春疫情趨勢(shì)究竟會(huì)如何發(fā)展?值得進(jìn)一步關(guān)注。
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ABSTRACT-1
The fifth epidemic wave of avian influenza A(H7N9) virus in China during 2016–2017 demonstrated a geographicrange expansion and caused more human cases than any previous wave. The factors that may explain the recent range expansion and surge in incidence remainunknown. We investigated the effect of anthropogenic, poultry, and wet land variables on all epidemic waves. Poultry predictor variables became much more important in the last 2 epidemic waves than they were previously, supporting the assumption of much wider H7N9 transmission in the chicken reservoir. We show that the future range expansion of H7N9 to northern China may increase therisk of H7N9 epidemic peaks coinciding in time and space with those of seasonal influenza, leading to a higher risk of reassortments than before, although the risk is still low so far.
ABSTRACT-2
A novel avian-origin influenza A(H7N9)virus emerged in China in March 2013 and by 27 September 2017 a total of 1533 laboratory-confirmed cases have been reported. Occurrences of animal-to-human and human-to-human transmission have been previously identified, and the forceof human-to-human transmission is an important component of risk assessment. In this study, we constructed an ecological model to evaluate the animal-to-humanand human-to-human transmission of H7N9 during the first three epidemic wavesin spring 2013, winter/spring 2013-2014 and winter/spring 2014-2015 in China based on 149 laboratory-confirmed urban cases. Our analysis of patterns inincidence in major cities allowed us to estimate a mean incubation period inhumans of 2.6 days (95% credibility interval, CrI: 1.4-3.1) and an effective reproduction number Re of 0.23 (95% CrI: 0.05-0.47) for the first wave, 0.16(95% CrI: 0.01-0.41) for the second wave, and 0.16 (95% CrI: 0.01-0.45) for the third wave without a significant difference between waves. There was asignificant decrease in the incidence of H7N9 cases after live poultry market closures in various major cities. Our analytic framework can be used forcontinued assessment of the risk of human to human transmission of A(H7N9)virus as human infections continue to occur in China.
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文章來(lái)源:
1. Artois J, Jiang H, Wang X, Qin Y,Pearcy M, Lai S, Shi Y, Zhang J, Peng Z, Zheng J, He Y, Dhingra MS, vonDobschuetz S, Guo F, Martin V, Kalpravidh W, Claes F, Robinson T, Hay SI, XiaoX, Feng L, Gilbert M, Yu H. Changing Geographic Patterns and RiskFactors for Avian Influenza A(H7N9) Infections in Humans, China. EmergInfect Dis. 2018 Jan;24(1):87-94. doi: 10.3201/eid2401.171393.
https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/24/1/17-1393_article
2.Victor Virlogeux V, Feng L,Tsang TK, Jiang H, Fang VJ, Qin Y, Wu P, Wang X, Zheng J, Lau EHY, Peng Z, YangJ, Cowling BJ, Yu H.Evaluation of animal-to-human and human-to-human transmission ofinfluenza A (H7N9) virus in China, 2013-15. Sci Rep. 2018 Jan11;8(1):552. doi: 10.1038/s41598-017-17335-9.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5765021/
3. 復(fù)旦大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院:余宏杰課題組在闡明人感染禽流感H7N9地理分布模式、傳播風(fēng)險(xiǎn)及活禽市場(chǎng)關(guān)閉效果方面取得進(jìn)展
https://sph.fudan.edu.cn/a/1540
4. 云南省衛(wèi)計(jì)委:云南省確診1例H7N9病例
https://www.pbh.yn.gov.cn/wjwWebsite/web/doc/UU151214550961002284
5.世界衛(wèi)生組織疫情更新:
https://www.who.int/csr/don/26-october-2017-ah7n9-china/en/
內(nèi)容來(lái)源:病毒學(xué)界
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卓誠(chéng)惠生——國(guó)內(nèi)多重PCR技術(shù)應(yīng)用的開(kāi)拓者
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